Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
P01649 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
P01649 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P01649 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01649 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01649 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01649 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01649 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01649 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P01649 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P01649 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms