Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01648 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01648 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01648 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01648 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01648 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01648 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01648 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01648 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01648 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms