Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ccl20O89093 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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