Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns1O88456 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns1O88456 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Capns1O88456 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Capns1O88456 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Capns1O88456 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Capns1O88456 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Capns1O88456 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Capns1O88456 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Capns1O88456 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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