Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CtssO70370 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CtssO70370 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CtssO70370 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CtssO70370 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtssO70370 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtssO70370 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CtssO70370 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CtssO70370 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms