Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

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Length 437 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgceO70258 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgceO70258 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SgceO70258 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SgceO70258 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SgceO70258 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SgceO70258 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SgceO70258 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SgceO70258 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SgceO70258 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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