Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Rhox6O70238 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhox6O70238 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhox6O70238 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhox6O70238 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhox6O70238 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhox6O70238 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhox6O70238 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhox6O70238 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Rhox6O70238 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms