Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
AurkbO70126 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms