Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RngttO55236 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RngttO55236 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RngttO55236 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RngttO55236 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RngttO55236 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RngttO55236 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RngttO55236 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RngttO55236 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RngttO55236 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RngttO55236 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RngttO55236 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RngttO55236 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RngttO55236 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RngttO55236 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms