Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ldb2O55203 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ldb2O55203 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Ldb2O55203 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ldb2O55203 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ldb2O55203 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ldb2O55203 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Ldb2O55203 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ldb2O55203 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ldb2O55203 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms