Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cbx4O55187 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cbx4O55187 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms