Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Dsg2O55111 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dsg2O55111 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms