Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc3O55013 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc3O55013 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms