Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pole2O54956 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pole2O54956 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pole2O54956 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms