Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Csnk2a2O54833 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Csnk2a2O54833 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms