Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Limk2O54785 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Limk2O54785 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms