Protein–RNA interactions for Protein: O35980

Nthl1, Endonuclease III-like protein 1, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nthl1O35980 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nthl1O35980 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nthl1O35980 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms