Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Ccl25O35903 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms