Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1dO35473 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1dO35473 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1dO35473 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1dO35473 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
C1dO35473 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1dO35473 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1dO35473 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C1dO35473 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.05■□□□□ 0
C1dO35473 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
C1dO35473 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1dO35473 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
C1dO35473 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
C1dO35473 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms