Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-ObO35424 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-ObO35424 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms