Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dgcr6O35347 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dgcr6O35347 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dgcr6O35347 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dgcr6O35347 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dgcr6O35347 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dgcr6O35347 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dgcr6O35347 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dgcr6O35347 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dgcr6O35347 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dgcr6O35347 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dgcr6O35347 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dgcr6O35347 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dgcr6O35347 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dgcr6O35347 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dgcr6O35347 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Dgcr6O35347 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms