Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms