Protein–RNA interactions for Protein: O35284

Batf, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BatfO35284 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
BatfO35284 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
BatfO35284 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
BatfO35284 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BatfO35284 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BatfO35284 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
BatfO35284 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BatfO35284 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
BatfO35284 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
BatfO35284 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
BatfO35284 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
BatfO35284 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BatfO35284 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BatfO35284 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BatfO35284 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BatfO35284 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BatfO35284 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BatfO35284 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BatfO35284 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BatfO35284 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BatfO35284 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BatfO35284 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BatfO35284 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BatfO35284 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
BatfO35284 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms