Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Bhlhe40O35185 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bhlhe40O35185 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms