Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smad6O35182 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smad6O35182 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms