Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Degs1O09005 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Degs1O09005 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Degs1O09005 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms