Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MttpO08601 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MttpO08601 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MttpO08601 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MttpO08601 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms