Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm5458L7N219 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm5458L7N219 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms