Protein–RNA interactions for Protein: K7N721

Gm3248, Predicted gene 3248, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3248K7N721 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gm3248K7N721 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3248K7N721 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3248K7N721 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm3248K7N721 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm3248K7N721 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm3248K7N721 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm3248K7N721 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm3248K7N721 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm3248K7N721 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3248K7N721 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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