Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm3542K7N6U2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3542K7N6U2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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