Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm6594J3QM43 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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