Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6176J3QK59 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm6176J3QK59 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms