Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem200cJ3QK46 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem200cJ3QK46 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms