Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vmn1r58G3X9U3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Vmn1r58G3X9U3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms