Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn34aG3UW52 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn34aG3UW52 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms