Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20517G3UVU6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms