Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Usp9yF8VPU6 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms