Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm3443F7CCV5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm3443F7CCV5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm3443F7CCV5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm3443F7CCV5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm3443F7CCV5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm3443F7CCV5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm3443F7CCV5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Gm3443F7CCV5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm3443F7CCV5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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