Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm8444F6XS56 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8444F6XS56 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms