Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Gm10378F6XQQ1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Gm10378F6XQQ1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm10378F6XQQ1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Gm10378F6XQQ1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Gm10378F6XQQ1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Gm10378F6XQQ1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Gm10378F6XQQ1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Gm10378F6XQQ1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Gm10378F6XQQ1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Gm10378F6XQQ1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm10378F6XQQ1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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