Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cald1E9QA15 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cald1E9QA15 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms