Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc7bE9Q9Y3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc7bE9Q9Y3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ccdc7bE9Q9Y3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ccdc7bE9Q9Y3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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