Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BC051665E9Q623 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC051665E9Q623 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms