Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FancfE9Q5Z5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FancfE9Q5Z5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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