Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
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ApobE9Q414 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
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ApobE9Q414 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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ApobE9Q414 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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ApobE9Q414 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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ApobE9Q414 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
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ApobE9Q414 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
ApobE9Q414 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
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