Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
4930579F01RikE9Q3L6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms