Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
6430550D23RikE9Q1X6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms