Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Myo5cE9Q1F5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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