Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Sfta2E9PXB6 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms