Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ttc17E9PVB5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ttc17E9PVB5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms